Az OAH a Kormány irányításával működő, önálló feladattal és hatósági jogkörrel rendelkező országos hatáskörű központi közigazgatási szerv. Az OAH alapvető feladatait és hatáskörét az atomenergiáról szóló törvény (1996. évi CXVI. tv.), és az OAH feladatáról, hatásköréről és bírságolási jogköréről, valamint az Atomenergia Koordinációs Tanács jogköréről szóló 114/2003. (VII. 29.) Korm. rendelet határozza meg.

Az OAH költségvetése a kijelölt miniszter által vezetett minisztériumköltségvetésében elkülönítetten jelenik meg.

Az atomenergiáról szóló törvény 1998. január 1-jei hatállyal Központi Nukleáris Pénzügyi Alapot hozott létre, amelynek forrását az atomenergiát alkalmazó létesítmények befizetései képezik. Az Alap célja a radioaktív hulladéktárolók létesítésének, a kiégett fűtőelemek ideiglenes tárolásának és végső elhelyezésének, valamint a nukleáris létesítmények végleges leállításának, leszerelésének finanszírozása. Az Alap által finanszírozott létesítések, vásárolt eszközök, készletek a kincstári vagyon részét képezik A nukleáris létesítmények üzemeltetőinek a tényleges üzemidő alatt fel kell halmozni az Alap célja szerinti feladatok ellátásához szükséges forrást. Ez alól kivételt képeznek a költségvetési intézmények által működtetett létesitmények.

A Kormánynak az OAH fölötti felügyeletét gyakorló tagja rendelkezik az Alappal, az Alap kezelője az OAH. Az OAH a radioaktív hulladéktárolók létesítésére, üzemeltetésére, fenntartására, valamint a nukleáris létesítmények leszerelésére létrehozta a Radioaktív Hulladékokat Kezelő Közhasznú Társaságot (RHK Kht.). Az RHK Kht. felelős a püspökszilágyi Radioaktív Hulladék Feldolgozó és Tároló, valamint a Kiégett Kazetták Átmeneti Tárolója üzemeltetéséért is. Feladatai közé tartozik a Központi Nukleáris Pénzügyi Alapból finanszírozott tevékenységekre vonatkozóan éves, közép- és hosszú távú tervek készítése. Az Alap kezelése során az OAH ellenőrzi az Alappal rendelkező miniszter által jóváhagyott közép- és hosszú távú terv, valamint az Alapból finanszírozott éves munkaprogram végrehajtását.